חוגים ופעליות: הפנימייה מפעילה רשת רחבה של פעוליות וחוגים לאורך כל השנה, כל ילד בפנימייה משתתף בשני חודים לפחות.
חלק מהחוגים מופעלים בתוך כותלי הפנימייה( מחשבים,אומנות,ספורט,מוסיקה) וחלק נוסף מתבצע מחוץ לפנימייה (רכיבה טיפולית, חדר כושר, כדורגל).

רכז ספורט: אחראי לכל הפעוליות הספורטיביות בפנימייה, מפעיל חוגי ספורט מגוונים וחוגים לתזונה נכונה לילדים עם משקל עודף.

מרכזייה חינוכית: המרכזיה החינוכית בפנימייה אל-אימאן מספקת הפעלות תוכניות חינוכיות לחמיכים בשיתוף המדרכים, תוכניות אלה מטרתן לטפל בבעיות שונות דרך משחק ויצירה, בצורת הפעלה כלומר באופן לא ישיר.
התוכניות בהן עוסקות תוכניות אלה מותאמות לגיל ולרקע של החניכים. כל התוכניות במרכזייה מסודדרות בתיקיות שמחולקות לצבעים וכל צבע נושא אחר, לדוגמה: תוכניות חינוכיות מטפלות בנושאי עישון, סמים גניבות, משחקי צורות, תוכניות העוסקות באירועים חגים, חודש רמדאן, עונות ועוד... כמו כן מכילה המרכזייה תוכניות לעבודת יד ויצירה, יש לציין שיש דוגמאות לכל העבודות להעזר בהן לכל החניכים יש אפשרות לצייר, לצבוע ולשחק במרכזייה.
המרכזייה מקיימת משחקים תחרויות כגון: קריאת ספרים, למידה שירה מחניים וכו'.
 
חדר מחשבים:
הוקם חדר מחשבים עם ציוד חדשני ומודרני שנותן מענה הולם לכל דרישה. הוא מונה 11 מחשבים ומקרן ניתן להרצות בחדר מחשבים, בליווי מדריך שמלמד את עקרונות המחשב, שיעניקו לחניכים את הרקע והידע הבסיסי בהפעלת מחשבים.

טיולים ומופעים: לאורך השנה הילדים משתתפים בטיולים ומופעים אומנותיים.

קייטנת הקיץ: בחופשת הקיץ מפעילה הפנימייה קייטנה במשך חודש, הילדים מבלים בבריכות בטיולים ובמופעים שונים, בסוף הקייטנה מוזמנים הילדים והורים למסיבת סיום משותפת וחגגית.

פינת חי: בפנימייה פינת חי אשר כוללת חיות בית ועופות, וציפורים מרהבים ביופים, ארנבות, הילדים אחרים בהשגחת מדריך על הפינה.